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3010__政治學系碩士在職專班 政府與公共事務組
3030__經濟學系碩士在職專班
3050__國家發展研究所碩士在職專班
4010__臨床醫學研究所碩士在職專班 臨床醫學研究組-一般醫學組(在職醫師)
4020__臨床醫學研究所碩士在職專班 臨床醫學研究組-外科醫學組(在職醫師)
4030__臨床醫學研究所碩士在職專班 臨床試驗組-在職醫師組
4040__臨床醫學研究所碩士在職專班 臨床試驗組-在職非醫師組
4050__臨床牙醫學研究所碩士在職專班
4060__分子醫學研究所碩士在職專班 (主修遺傳諮詢)
5010__土木工程學系碩士在職專班 管理組
5020__土木工程學系碩士在職專班 技術組
5030__環境工程學研究所碩士在職專班 環境規劃與管理組
5040__工業工程學研究所碩士在職專班 「跨領域整合與創新」高階主管專班(臺大EMS)
6010__農業經濟學系碩士在職專班 農業經營管理高階主管專班(農經EMBA)
6030__生物產業傳播暨發展學系碩士在職專班 農業創新傳播高階主管專班(生傳EMBA)
7010__創業創新管理碩士在職專班
8010__健康政策與管理研究所高階經營碩士在職專班 甲組
8030__健康政策與管理研究所高階經營碩士在職專班 乙組
8040__流行病學與預防醫學研究所碩士在職專班
9010__資訊工程學系碩士在職專班
9020__電信工程學研究所智慧科技與資訊安全碩士在職專班
E010__事業經營碩士在職學位學程
E030__事業經營法務碩士在職學位學程
E050__生物科技管理碩士在職學位學程
M010__管理學院企業管理碩士專班(Global MBA)
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